交通运输工程学科是主要研究交通运输系统构成要素及其相互作用关系的科学，涉及交通基础设施的设计施工与养护、载运工具的运用与维修、交通信息工程及控制、运输规划与运营等。交通运输系统的构成要素包括产生交通运输需求的主体、载运工具、交通运输基础设施和控制系统。随着国民经济、社会发展和人民生活水平的提高对交通运输系统的发展提出更高的要求。该专业主要面向经济社会产业部门专业需求，培养交通运输工程领域专业人才，其目的重在知识、技术的应用能力。

西南林业大学交通运输工程专业学位授权点于2010年获批，2011年开始招收全日制硕士学位研究生。目前学校招收交通运输专业学位硕士生的校内导师共12人，其中教授4人，副教授5人，高级工程师1人，高级实验师2人；具有博士学位6人，占导师总人数的50.0%，具有硕士学位6人。目前有载运工具运用与管理、交通信息工程与控制、交通运输规划与管理、交通运输安全工程、轨道工程运用工程五个研究方向。